西城區疾病預防控制中心（簡稱西城區疾控中心），是具有獨立法人地位的衛生檢測機構，可承擔西城區公共衛生、疾病預防與控制、突發公共衛生事件處理等檢測任務，向社會提供各類檢測數據及除害滅病技術服務和咨詢。

2020年4月，被列入北京市面向團體提供新冠病毒核酸檢測服務醫療機構名單。  2020年9月8日，被表彰為全國抗擊新冠肺炎疫情先進集體。

西城區疾病預防控制中心具有獨立的實驗室資格，并向社會承諾以科學、公正的態度獨立開展檢測工作，不受任何內部和外部商業、財務及其他壓力的影響，確保檢測數據的公正、可靠。

西城區疾控中心其前身為西城區衛生防疫站，始建于1953年4月，1993年8月搬入新址，占地面積1849平方米，建筑面積4893平方米，檢驗室面積822平方米。2001年12月26日改名為西城區疾病預防控制中心。1998年3月第一次通過了北京市質量技術監督局的“計量認證”。經過半個世紀的發展，辦公條件和檢測人員的素質均有了很大提高，以滿足日益發展的檢測工作的需要。

西城區疾控中心現有在職人員127人，其中質檢人員69人，中、高級職稱人員37人，占質檢總人數的53.6%。中心設有辦公室、行政科、流行病科、免疫預防科、性病艾滋病防治科、食品與營養衛生科、環境衛生科、職業與放射衛生科、微生物檢驗科、理化檢驗科、臨床檢驗科、體檢科、慢病科、健康教育科、信息科等近二十個科室。配備有日立7020全自動生化分析儀、VITEK全自動微生物生化儀、日立Z-5000型原子吸收分光光度計、島津GC-14B氣相色譜儀、美國戴安離子色譜儀、F108-5遙控透視X射線機及體檢裝備X線透視車等大型儀器設備125余臺（套）。能開展包括食品、公共場所、水質、職業危害、消毒產品及衛生用品等類別的衛生學檢測169項。

中心將進一步加強內涵建設，以人才為重點，不斷引進高級科技人才，用三年時間，達到以研究生為骨干，以大學本科生為主體，以大學專科生為基礎力量的人才結構目標。積極開展新業務新技術，不斷創新，最大限度地滿足客戶需求。為西城區衛生防病事業的發展做貢獻。