南充市疾病預防控制中心成立于2004年4月，是主要從事疾病預防控制與公共衛生技術管理和服務的公益一類事業單位，同時掛有“南充市衛生檢測檢驗中心”的牌子。是四川大學、川北醫學院及雅安職業技術學院的教學實踐基地。依法承擔疾病預防控制、突發公共衛生事件應急處置、疫情報告及健康相關因素信息管理、健康危害因素監測與干預、實驗室檢測分析與評價、健康教育與健康促進等公共職能。

中心內設：辦公室、人事科、財務科、業務與質量管理科、信息與宣教科、急性傳染病防控科、免疫規劃科、性病艾滋病防控科、結核病與地方病防控科、慢性非傳染性疾病防控科、職業病與輻射健康危害防控科、營養與食品健康危害防控科、環境健康危害防控科、微生物檢驗科、理化檢驗科、預防醫學門診部共16個科室。現有職工100人，大專以上學歷占94%，其中碩士研究生學歷7人，大學本科學歷55人，大專學歷32人；專業技術人員占82%，其中高級職稱22人，中級職稱20人，初級職稱40人。機構總面積為8461平方米，其中辦公面積4361平方米（其中業務用房1100平方米），實驗室面積4100平方米，P2以上生物安全實驗室200平方米。設有理化檢測室、微生物檢測室、食品檢測室、流感檢測室、血清學檢測室、病媒生物室、結核病實驗室、艾滋病檢測室等。中心現有儀器設備598臺件。其中50萬元以上儀器設備21臺件，進口儀器設備195臺件。中心設備配置滿足開展包括水及涉水產品、公共場所及學校衛生、職業衛生、放射衛生、食品、食品接觸與包裝材料在內的10大檢測類別533個檢測項目。共取得放射衛生技術服務機構、檢驗檢測機構資質認定、職業病診斷機構、職業病健康檢查機構、輻射安全許可、二級生物安全實驗室、醫療機構執業許可共7個服務資質。

南充市疾病預防控制中心成立以來，在市委、市政府正確領導下，市衛健委直接關懷和上級有關部門支持下，以科學防病、規范管理，服務社會為理念，按“樹形象、爭一流、促發展”思路，堅持以人為本，全面推行人事制度改革，實施中層干部競爭上崗和全員聘用制。認真貫徹執行預防為主的衛生工作方針，切實履行疾病控制機構職責，狠抓常見病，多發病和重點疾病防控，強化疫情報告信息網絡建設，大力開展疾病、健康危害因素監測與評價;普及健康教育、及時處理各類傳染病疫情和突發公共衛生事件，為保障全市人民身體健康和生命,安全經濟發展與社會進步發揮了應有的作用。先后獲得衛生部“結核病防治工作先進集體”、四川省“疾病預防控制先進集體”、“計劃免疫工作先進集體”、“職業衛生先進集體”、 “公共場所監測先進集體”、南充市“防治非典工作先進集體”、“創建省級衛生先進集體”、“全市衛生系統先進集體”等榮譽。