醫院創辦于1958年，1996年通過“二級甲等醫院”和“國家愛嬰醫院”評審，2010年3月升級為深圳市坪山新區人民醫院，2017年7月更名為深圳市坪山區人民醫院，是集醫療、急救、預防、保健、康復、教學、科研為一體的區級綜合性醫院。擁有廣東省高等醫學院校教學基地、廣東省全科醫師臨床教學實踐基地資質。為廣州醫科大學、廣東藥科大學、湖北醫藥學院臨床教學醫院和武漢大學公共衛生學院創新實踐基地。是香港大學深圳醫院對口合作單位，坪山區與南方醫科大學合作共建的醫療健康集團(南方醫科大學坪山總醫院)核心醫院。

　　2019年9月，坪山區人民政府與南方醫科大學簽訂《合作共建坪山區醫療健康集團協議》，坪山區人民醫院成為坪山區與南方醫科大學合作共建的醫療健康集團核心主體。醫院在坪山區委區政府和南方醫科大學的領導下，在上級主管部門精心指導和社會各界的大力支持下，堅持“精醫重道、至誠至善”辦院理念，以建設群眾滿意的醫院為目標，加強基礎建設，強化內部管理，不斷提高醫療質量和服務水平，經過不懈努力，醫院規模不斷擴大，醫療環境明顯改善，群眾滿意度穩步提高。

　　作為坪山區與南方醫科大學合作共建的醫療健康集團核心主體，坪山區人民醫院將充分發揮南方醫科大學的學科人才和技術平臺優勢，通過探索建立政校聯合、醫防融合、醫康整合、醫養結合的醫療衛生與健康服務新模式，為坪山市民提供高質量、全方位、全生命周期的醫療健康服務。

　　醫院將牢牢把握廣東省、深圳市打造廣深醫療高地，以及深圳實施“東進戰略”和坪山成立行政區后大建設大發展和打造區域特色醫療中心的歷史機遇，適應轄區經濟社會發展要求和群眾不斷增長的醫療服務需求，近期將通過在現址實施二期改造項目，加快醫療設備升級換代，全力推進就醫環境、服務水平、醫療水平、服務質量明顯提升，不斷改善轄區群眾就醫體驗和社會評價。中長期，將根據深圳市和坪山區已經確定的醫院整體遷址新建項目規劃，按照2000張床位的規模和三級甲等醫院標準，加快推進新院區建設，努力將醫院建設成為群眾滿意、放心的人民醫院。

　　2017年掛牌成為湖北醫藥學院第八臨床學院、湖北醫藥學院附屬深圳坪山醫院、湖北醫藥學院藥護學院附屬深圳坪山醫院，實現坪山區醫學院校附屬醫院“0”的突破;成功導入廣東省醫療質量巡查服務體系，在全市首次公立醫院綜合評價之二級綜合醫院中排名第三名，其中競爭力排名第三名、公益性排名第四名，榮獲2017年廣東省縣域(區)優秀醫院管理團隊獎，獲評2017年全國綜合醫院中醫藥工作示范單位。2018年取得廣東省醫療服務質量評估區級考核第一名;5月12日掛牌成為上海復旦大學附屬華山醫院陳星榮影像會診中心深圳分中心;榮獲2018年度深圳市院前急救、急診綜合考核A級單位;獲評2018年度坪山區愛嬰醫院先進單位;榮獲2019年度深圳市院前急救、急診綜合考核A級單位。醫院還先后榮獲市級“健康促進(金獎)醫院”、“醫患和諧示范崗”“巾幗文明示范崗”“先進基層黨組織”等榮譽，連年受到市衛生健康委表彰。

　　醫院現有泌尿外科、骨科、兒科、耳鼻喉科、麻醉科5個區級重點學科。此外，神經外科、胃腸外科、放射介入、無痛診療和全科醫學業務也得到快速發展。