龍巖市第二醫院前身為1898年創辦的救世醫院（1951年更名為廈門市第二醫院），1970年醫院整體遷至龍巖，成為福建生產建設兵團一師醫院，1977年由龍巖地區行政公署接管后改名為龍巖地區第二醫院。歷經百年滄桑，現已發展成為一所綜合實力強大、專科特色鮮明的大型綜合性三級醫院。

近年來，我院通過與原第二軍醫大學附屬長海醫院、中國醫學科學院腫瘤醫院、廣東省人民醫院、天津市眼科醫院、福建省腫瘤醫院、福建醫科大學孟超肝膽醫院等國內一流醫院建立長期合作幫扶關系，培育了一批在醫療技術、醫療質量、臨床研究等方面具有閩西乃至福建一流水平的優勢專科，其中省級重點專科1個，市級重點專科12個，醫療服務能力顯著提升，病人滿意度連續5年位居全省前列。2020年被中央文明委評為“第六屆全國文明單位”，被省委授予“全省先進基層黨組織”稱號。

進入新時代，醫院堅持以習近平新時代中國特色社會主義思想為指導，秉持人民至上、生命至上理念，以推動高質量發展為主題，以提升服務能力為主線，以學科、人才隊伍和信息化建設為支撐，以建設有特色高水平三級甲等綜合性醫院為引領，著力構建閩西腫瘤防治中心、閩西傳染病防治中心、閩西肝病防治中心、閩西結石防治中心、閩西眼科防治中心、閩西健康管理中心等六大專科專病中心，打造閩西醫療技術一流、醫療質量過硬、醫療服務高效、醫院管理精細、人民群眾滿意的區域龍頭醫院。