蘇州市疾病預防控制中心（以下簡稱疾控中心）是由蘇州市政府舉辦的、直屬于蘇州市衛生局領導的、業務上接受江蘇省疾病預防控制中心指導的、在轄區內實施疾病預防控制與公共衛生技術服務的行政管理類事業單位。

疾控中心是按照蘇州市衛生改革總體目標和有效利用衛生資源的要求，在原蘇州市衛生防疫站、蘇州市血吸蟲病防治站、蘇州市皮膚病防治所、蘇州市結核病防治所、蘇州市健康教育所的基礎上，于2001年10月25日組建而成的集疾病預防與控制、衛生檢驗與衛生學評價、健康教育與促進、應用研究與業務指導、技術管理與服務為一體的衛生防病機構。

疾控中心現坐落于蘇州市三香路72號，占地面積10400平方米，工作用房15000平方米，擁有總價值7000余萬元的各類衛生檢測儀器設備，現有在編人員188人，平均年齡40.5歲，研究生以上學歷人員占36％，本科人員占44％，高級專技人員占33％，中級專技人員占36％。

疾控中心設有綜合辦公室(監察室)、應急（綜合業務）辦公室、科教人事科、規劃財務科、總務設備科、傳染病防制科、性病艾滋病防制科、血（吸蟲）寄（生蟲）地（方病）慢防制科、結核病防治所、食品與學校衛生科、環境衛生科、職業（放射）衛生科、預防醫學診療部、檢驗科、質量管理科、信息科、健康教育所、工會．共青團．退管會辦公室、預防醫學會．防癆協會辦公室等科室部門。

疾控中心秉承原各組建單位60余年的優良傳統，積極貫徹“預防為主”的工作方針，實施科教興衛戰略，以社會效益為宗旨，堅持質量第一，進行科學管理，開展優質服務，在有關法律、法規和技術標準的框架內，依靠軟硬件建設，保證服務和產品質量，實現準確性、有效性和公正性。