中國科學院沈陽應用生態研究所(以下簡稱沈陽生態所)成立于1954年，其前身為中國科學院林業土壤研究所，1987年更為現名，2001年成為國家知識創新工程試點單位，2015年成為中國科學院“生態文明建設”領域首批特色研究所試點單位。1987年，根據中國科學院強化生態資源環境研究的戰略部署及學科需要，研究所更名為“中國科學院沈陽應用生態研究所”。學科定位為以陸地生態系統為研究對象，以現代生態學為主攻學科，主要開展宏觀生態學、系統生態學、實驗生態學，生物工程與生物技術等領域的研究。