擬訂農業資源與環境保護的相關政策法規、規劃與年度計劃，并組織實施;承擔農業野生植物資源管理與保護、外來入侵生物管理與防治以及農用地、宜農灘涂、宜農濕地、農業生物物種資源的保護和管理工作;組織開展農業面源污染防治和農業污染事故查處;承擔農村清潔工程建設、生態農業、循環農業和農村減排工作;指導農業資源環境管理和監測體系建設;承擔和參與農產品產地環境、農業轉基因生物及其制品和農產品質量安全的監測;承擔農業重大項目環境影響評價工作，組織農業資源與環境保護技術示范推廣;承擔上級交辦的其他事項。