馬鞍山市疾病預防控制中心是在原馬鞍山市衛生防疫站、血吸蟲病防治站、結核病防治所等多家單位基礎上，于2000年組建而成的實施全市疾病預防控制與公共衛生技術服務的副縣級行政管理類事業單位，直屬于市衛生計生委領導。主要承擔全市疾病監測、重大突發公共衛生事件調查處理、兒童免疫規劃、公共衛生監測與評價、衛生醫學檢驗以及艾滋病、結核病、血吸蟲病等重大傳染性疾病和職業病、地方病的預防控制與健康教育促進等工作。