根據《關于同意市衛生局所屬事業單位清理規范方案的函》（京編辦事[2012]165號），北京市預防醫學研究中心是北京市衛生健康委員會直屬公益一類正處級事業單位。主要職責包括開展預防醫學研究，促進衛生事業發展。（一）流行病與衛生統計（二）勞動衛生與環境衛生、營養與食品衛生研究（三）傳染病、慢性病、地方病、寄生蟲病防治（四）婦女少兒衛生保護（五）衛生經濟、職業衛生、放射衛生防護、健康專業學科研究（六）職業病診斷、管理與職業衛生培訓（七）擬定職業衛生規范、檢測評價（八）提供職業衛生信息資料（九）職業中毒事故調查、檢測（十）建設項目職業衛生預評（十一）咨詢與服務（十二）民品安全質檢（十三）職業健康體檢評價（十四）衛生標準及其它科研